Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX2

Pdcl, Phosducin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdclQ9DBX2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdclQ9DBX2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdclQ9DBX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdclQ9DBX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdclQ9DBX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdclQ9DBX2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdclQ9DBX2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdclQ9DBX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdclQ9DBX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdclQ9DBX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdclQ9DBX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms