Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx59Q9DBN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx59Q9DBN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx59Q9DBN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx59Q9DBN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx59Q9DBN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx59Q9DBN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx59Q9DBN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx59Q9DBN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx59Q9DBN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms