Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fundc1Q9DB70 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fundc1Q9DB70 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fundc1Q9DB70 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fundc1Q9DB70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fundc1Q9DB70 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fundc1Q9DB70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fundc1Q9DB70 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fundc1Q9DB70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fundc1Q9DB70 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fundc1Q9DB70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms