Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf4Q9DAW6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf4Q9DAW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpf4Q9DAW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prpf4Q9DAW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prpf4Q9DAW6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prpf4Q9DAW6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prpf4Q9DAW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf4Q9DAW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf4Q9DAW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf4Q9DAW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms