Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR5

1700001F09Rik, RIKEN cDNA 1700001F09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001F09RikQ9DAR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700001F09RikQ9DAR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700001F09RikQ9DAR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700001F09RikQ9DAR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700001F09RikQ9DAR5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700001F09RikQ9DAR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700001F09RikQ9DAR5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700001F09RikQ9DAR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms