Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sgf29Q9DA08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sgf29Q9DA08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgf29Q9DA08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sgf29Q9DA08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgf29Q9DA08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sgf29Q9DA08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sgf29Q9DA08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sgf29Q9DA08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sgf29Q9DA08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sgf29Q9DA08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms