Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actrt1Q9D9J3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actrt1Q9D9J3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Actrt1Q9D9J3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actrt1Q9D9J3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actrt1Q9D9J3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Actrt1Q9D9J3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Actrt1Q9D9J3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actrt1Q9D9J3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actrt1Q9D9J3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Actrt1Q9D9J3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actrt1Q9D9J3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms