Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntd1Q9D995 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntd1Q9D995 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntd1Q9D995 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntd1Q9D995 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntd1Q9D995 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntd1Q9D995 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntd1Q9D995 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntd1Q9D995 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntd1Q9D995 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms