Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Borcs5Q9D920 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Borcs5Q9D920 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Borcs5Q9D920 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Borcs5Q9D920 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Borcs5Q9D920 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Borcs5Q9D920 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Borcs5Q9D920 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms