Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms