Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec23bQ9D662 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec23bQ9D662 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sec23bQ9D662 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23bQ9D662 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23bQ9D662 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23bQ9D662 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23bQ9D662 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23bQ9D662 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23bQ9D662 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms