Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabl3Q9D4V7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabl3Q9D4V7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rabl3Q9D4V7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rabl3Q9D4V7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rabl3Q9D4V7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rabl3Q9D4V7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabl3Q9D4V7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabl3Q9D4V7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabl3Q9D4V7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabl3Q9D4V7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabl3Q9D4V7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabl3Q9D4V7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms