Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tomm20lQ9D4V6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tomm20lQ9D4V6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20lQ9D4V6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tomm20lQ9D4V6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tomm20lQ9D4V6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tomm20lQ9D4V6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tomm20lQ9D4V6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tomm20lQ9D4V6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tomm20lQ9D4V6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms