Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lonrf3Q9D4H7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lonrf3Q9D4H7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lonrf3Q9D4H7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lonrf3Q9D4H7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lonrf3Q9D4H7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lonrf3Q9D4H7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lonrf3Q9D4H7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lonrf3Q9D4H7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lonrf3Q9D4H7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lonrf3Q9D4H7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lonrf3Q9D4H7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lonrf3Q9D4H7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms