Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4G9

Rmi1, RecQ-mediated genome instability protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi1Q9D4G9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rmi1Q9D4G9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rmi1Q9D4G9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rmi1Q9D4G9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rmi1Q9D4G9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rmi1Q9D4G9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rmi1Q9D4G9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rmi1Q9D4G9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rmi1Q9D4G9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms