Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pabpc6Q9D4E6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pabpc6Q9D4E6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pabpc6Q9D4E6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pabpc6Q9D4E6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pabpc6Q9D4E6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pabpc6Q9D4E6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pabpc6Q9D4E6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Pabpc6Q9D4E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pabpc6Q9D4E6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pabpc6Q9D4E6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pabpc6Q9D4E6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc6Q9D4E6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc6Q9D4E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pabpc6Q9D4E6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pabpc6Q9D4E6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pabpc6Q9D4E6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pabpc6Q9D4E6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pabpc6Q9D4E6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pabpc6Q9D4E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pabpc6Q9D4E6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pabpc6Q9D4E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc6Q9D4E6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc6Q9D4E6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pabpc6Q9D4E6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms