Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
4933402E13RikQ9D4D2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
4933402E13RikQ9D4D2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
4933402E13RikQ9D4D2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
4933402E13RikQ9D4D2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
4933402E13RikQ9D4D2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
4933402E13RikQ9D4D2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4933402E13RikQ9D4D2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4933402E13RikQ9D4D2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4933402E13RikQ9D4D2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933402E13RikQ9D4D2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4933402E13RikQ9D4D2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4933402E13RikQ9D4D2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4933402E13RikQ9D4D2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms