Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Odf2lQ9D478 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Odf2lQ9D478 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Odf2lQ9D478 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Odf2lQ9D478 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Odf2lQ9D478 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Odf2lQ9D478 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Odf2lQ9D478 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Odf2lQ9D478 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Odf2lQ9D478 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Odf2lQ9D478 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Odf2lQ9D478 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Odf2lQ9D478 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Odf2lQ9D478 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Odf2lQ9D478 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Odf2lQ9D478 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Odf2lQ9D478 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Odf2lQ9D478 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Odf2lQ9D478 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Odf2lQ9D478 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Odf2lQ9D478 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms