Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OxsmQ9D404 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OxsmQ9D404 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OxsmQ9D404 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OxsmQ9D404 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OxsmQ9D404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OxsmQ9D404 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OxsmQ9D404 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OxsmQ9D404 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms