Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430402E10RikQ9D3N5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5430402E10RikQ9D3N5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5430402E10RikQ9D3N5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5430402E10RikQ9D3N5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
5430402E10RikQ9D3N5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430402E10RikQ9D3N5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430402E10RikQ9D3N5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms