Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D3J9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D3J9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D3J9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D3J9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D3J9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D3J9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D3J9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D3J9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D3J9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D3J9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D3J9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D3J9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D3J9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D3J9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9D3J9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9D3J9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D3J9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D3J9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D3J9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms