Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf128Q9D304 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf128Q9D304 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf128Q9D304 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf128Q9D304 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf128Q9D304 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf128Q9D304 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf128Q9D304 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms