Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2U0

Psg23, MCG140255, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg23Q9D2U0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psg23Q9D2U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psg23Q9D2U0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psg23Q9D2U0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psg23Q9D2U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psg23Q9D2U0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psg23Q9D2U0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psg23Q9D2U0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psg23Q9D2U0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psg23Q9D2U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psg23Q9D2U0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms