Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pramef12Q9D2F1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pramef12Q9D2F1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramef12Q9D2F1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pramef12Q9D2F1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pramef12Q9D2F1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pramef12Q9D2F1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pramef12Q9D2F1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pramef12Q9D2F1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pramef12Q9D2F1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Pramef12Q9D2F1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pramef12Q9D2F1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pramef12Q9D2F1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pramef12Q9D2F1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pramef12Q9D2F1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pramef12Q9D2F1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pramef12Q9D2F1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pramef12Q9D2F1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pramef12Q9D2F1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pramef12Q9D2F1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef12Q9D2F1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pramef12Q9D2F1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pramef12Q9D2F1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms