Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MrnipQ9D1F5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MrnipQ9D1F5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MrnipQ9D1F5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MrnipQ9D1F5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MrnipQ9D1F5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MrnipQ9D1F5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms