Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cthrc1Q9D1D6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cthrc1Q9D1D6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cthrc1Q9D1D6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cthrc1Q9D1D6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cthrc1Q9D1D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cthrc1Q9D1D6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cthrc1Q9D1D6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms