Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt5Q9D0C4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt5Q9D0C4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt5Q9D0C4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trmt5Q9D0C4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt5Q9D0C4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt5Q9D0C4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt5Q9D0C4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt5Q9D0C4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt5Q9D0C4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms