Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2v1Q9CZY3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2v1Q9CZY3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2v1Q9CZY3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2v1Q9CZY3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2v1Q9CZY3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2v1Q9CZY3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2v1Q9CZY3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms