Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl35Q9CZ49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl35Q9CZ49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl35Q9CZ49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl35Q9CZ49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl35Q9CZ49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl35Q9CZ49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl35Q9CZ49 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhl35Q9CZ49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhl35Q9CZ49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms