Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdhd3Q9CYW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdhd3Q9CYW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdhd3Q9CYW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd3Q9CYW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdhd3Q9CYW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms