Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChtopQ9CY57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChtopQ9CY57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChtopQ9CY57 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChtopQ9CY57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChtopQ9CY57 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChtopQ9CY57 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChtopQ9CY57 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChtopQ9CY57 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChtopQ9CY57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChtopQ9CY57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChtopQ9CY57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms