Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrps28Q9CY16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrps28Q9CY16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrps28Q9CY16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrps28Q9CY16 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps28Q9CY16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps28Q9CY16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps28Q9CY16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrps28Q9CY16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrps28Q9CY16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps28Q9CY16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrps28Q9CY16 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps28Q9CY16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms