Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mgme1Q9CXC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mgme1Q9CXC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mgme1Q9CXC3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mgme1Q9CXC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mgme1Q9CXC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgme1Q9CXC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgme1Q9CXC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms