Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX21

9430069I07Rik, MCG131781, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430069I07RikQ9CX21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9430069I07RikQ9CX21 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9430069I07RikQ9CX21 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9430069I07RikQ9CX21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9430069I07RikQ9CX21 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
9430069I07RikQ9CX21 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430069I07RikQ9CX21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430069I07RikQ9CX21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9430069I07RikQ9CX21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms