Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ist1Q9CX00 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ist1Q9CX00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ist1Q9CX00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ist1Q9CX00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ist1Q9CX00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ist1Q9CX00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ist1Q9CX00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ist1Q9CX00 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms