Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mcm8Q9CWV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcm8Q9CWV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcm8Q9CWV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mcm8Q9CWV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcm8Q9CWV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcm8Q9CWV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcm8Q9CWV1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Mcm8Q9CWV1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcm8Q9CWV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms