Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb2bQ9CWF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb2bQ9CWF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubb2bQ9CWF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubb2bQ9CWF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb2bQ9CWF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb2bQ9CWF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb2bQ9CWF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubb2bQ9CWF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb2bQ9CWF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb2bQ9CWF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb2bQ9CWF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb2bQ9CWF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms