Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVB6

Arpc2, Actin-related protein 2/3 complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc2Q9CVB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arpc2Q9CVB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arpc2Q9CVB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arpc2Q9CVB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arpc2Q9CVB6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arpc2Q9CVB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arpc2Q9CVB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arpc2Q9CVB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arpc2Q9CVB6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arpc2Q9CVB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arpc2Q9CVB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arpc2Q9CVB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arpc2Q9CVB6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Arpc2Q9CVB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arpc2Q9CVB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arpc2Q9CVB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arpc2Q9CVB6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arpc2Q9CVB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms