Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a2Q9CTG6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a2Q9CTG6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a2Q9CTG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a2Q9CTG6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp13a2Q9CTG6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a2Q9CTG6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a2Q9CTG6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms