Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chchd3Q9CRB9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chchd3Q9CRB9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chchd3Q9CRB9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chchd3Q9CRB9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chchd3Q9CRB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chchd3Q9CRB9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chchd3Q9CRB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chchd3Q9CRB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chchd3Q9CRB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms