Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras2Q9CR56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras2Q9CR56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkiras2Q9CR56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkiras2Q9CR56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkiras2Q9CR56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkiras2Q9CR56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkiras2Q9CR56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms