Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PpidQ9CR16 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PpidQ9CR16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PpidQ9CR16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PpidQ9CR16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PpidQ9CR16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PpidQ9CR16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PpidQ9CR16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PpidQ9CR16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PpidQ9CR16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PpidQ9CR16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PpidQ9CR16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms