Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4931417E11RikQ9CR05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931417E11RikQ9CR05 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4931417E11RikQ9CR05 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4931417E11RikQ9CR05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4931417E11RikQ9CR05 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms