Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tma16Q9CR02 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tma16Q9CR02 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tma16Q9CR02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tma16Q9CR02 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tma16Q9CR02 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tma16Q9CR02 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tma16Q9CR02 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tma16Q9CR02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tma16Q9CR02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms