Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms