Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ykt6Q9CQW1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ykt6Q9CQW1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ykt6Q9CQW1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ykt6Q9CQW1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ykt6Q9CQW1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ykt6Q9CQW1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms