Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nicn1Q9CQM0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nicn1Q9CQM0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nicn1Q9CQM0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nicn1Q9CQM0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nicn1Q9CQM0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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