Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd2aQ9CQJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd2aQ9CQJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Higd2aQ9CQJ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Higd2aQ9CQJ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd2aQ9CQJ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd2aQ9CQJ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms