Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpb2Q9CQI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpb2Q9CQI7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpb2Q9CQI7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpb2Q9CQI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpb2Q9CQI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snrpb2Q9CQI7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpb2Q9CQI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.8 ms