Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms